home *** CD-ROM | disk | FTP | other *** search
/ Shareware Overload Trio 2 / Shareware Overload Trio Volume 2 (Chestnut CD-ROM).ISO / dir26 / med9406b.zip / M9460181.TXT < prev    next >
Text File  |  1994-06-12  |  4KB  |  54 lines
  1.        Document 0181
  2.  DOCN  M9460181
  3.  TI    Correct splicing despite mutation of the invariant first nucleotide of a
  4.        5' splice site: a possible basis for disparate clinical phenotypes in
  5.        siblings with adenosine deaminase deficiency.
  6.  DT    9408
  7.  AU    Arredondo-Vega FX; Santisteban I; Kelly S; Schlossman CM; Umetsu DT;
  8.        Hershfield MS; Department of Medicine, Duke University Medical Center,
  9.        Durham,; NC 27710.
  10.  SO    Am J Hum Genet. 1994 May;54(5):820-30. Unique Identifier : AIDSLINE
  11.        MED/94234148
  12.  AB    Adenosine deaminase (ADA) deficiency usually causes severe combined
  13.        immune deficiency in infancy. Milder phenotypes, with delayed or late
  14.        onset and gradual decline in immune function, also occur and are
  15.        associated with less severely impaired deoxyadenosine (dAdo) catabolism.
  16.        We have characterized the mutations responsible for ADA deficiency in
  17.        siblings with striking disparity in clinical phenotype. Erythrocyte dAdo
  18.        nucleotide pool size, which reflects total residual ADA activity, was
  19.        lower in the older, more mildly affected sib (RG) than in her younger,
  20.        more severely affected sister (EG). Cultured T cells, fibroblasts, and B
  21.        lymphoblasts of RG had detectable residual ADA activity, while cells of
  22.        EG did not. ADA mRNA was undetectable by northern analysis in these
  23.        cells of both patients. Both sibs were found to be compound
  24.        heterozygotes for the following novel splicing defects: (1) a G+1-->A
  25.        substitution at the 5' splice site of IVS 2 and (2) a complex 17-bp
  26.        rearrangement of the 3' splice site of IVS 8, which inserted a run of
  27.        seven purines into the polypyrimidine tract and altered the reading
  28.        frame of exon 9. PCR-amplified ADA cDNA clones with premature
  29.        translation stop codons arising from aberrant pre-mRNA splicing were
  30.        identified, which were consistent with these mutations. However, some
  31.        cDNA clones from T cells of both patients and from fibroblasts and
  32.        Epstein-Barr virus (EBV)-transformed B cells of RG, were normally
  33.        spliced at both the exon 2/3 and exon 8/9 junctions. A normal coding
  34.        sequence was documented for clones from both sibs. The normal cDNA
  35.        clones did not appear to arise from either contamination or PCR
  36.        artifact, and mosaicism seems unlikely to have been involved. These
  37.        findings suggest (1) that a low level of normal pre-mRNA splicing may
  38.        occur despite mutation of the invariant first nucleotide of the 5'
  39.        splice donor sequence and (2) that differences in efficiency of such
  40.        splicing may account for the difference in residual ADA activity, immune
  41.        dysfunction, and clinical severity in these siblings.
  42.  DE    Adenosine Deaminase/*DEFICIENCY/*GENETICS/METABOLISM  Base Sequence
  43.        Case Report  Cell Line  Cells, Cultured  Child, Preschool
  44.        DNA/CHEMISTRY/GENETICS  DNA Primers  Exons  Female
  45.        Fibroblasts/ENZYMOLOGY  Heterozygote Detection  Human  Infant  Molecular
  46.        Sequence Data  Nuclear Family  Phenotype  *Point Mutation  Polymerase
  47.        Chain Reaction  *RNA Splicing  RNA, Messenger/ANALYSIS  Severe Combined
  48.        Immunodeficiency/ENZYMOLOGY/*GENETICS  Support, Non-U.S. Gov't  Support,
  49.        U.S. Gov't, P.H.S.  T-Lymphocytes/ENZYMOLOGY  JOURNAL ARTICLE
  50.  
  51.        SOURCE: National Library of Medicine.  NOTICE: This material may be
  52.        protected by Copyright Law (Title 17, U.S.Code).
  53.  
  54.